cfDNA的羟甲基化为早期胰腺癌筛查提供

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导读

研究背景：胰腺癌是一种恶性程度很高，诊断和治疗都很困难的消化道恶性肿瘤，约90%为起源于腺管上皮的导管腺癌（PDAC）。其发病率和死亡率近年来明显上升。5年生存率1%，是预后最差的恶性肿瘤之一。胰腺癌的病因尚不十分清楚。其发生与吸烟、饮酒、高脂肪和高蛋白饮食、过量饮用咖啡、环境污染及遗传因素有关；近年来的调查报告发现糖尿病人群中胰腺癌的发病率明显高于普通人群；也有人注意到慢性胰腺炎病人与胰腺癌的发病存在一定关系，发现慢性胰腺炎病人发生胰腺癌的比例明显增高；另外还有许多因素与此病的发生有一定关系，如职业、环境、地理等。使用基因组学和蛋白组学的转化研究技术已为胰腺癌的发病机理和生物学过程提供了分子水平的见解，但仍未产生强有力的诊断标志物来影响疾病的早期判断。方法与结果：本文作者通过对64个PDAC患者和个非癌患者的游离DNA（circulatingcellfreeDNA，cfDNA）的5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）检测，发现上千个差异羟甲基化的gene中，其中最显著的是与胰腺发育或功能相关的gene（GATA4,GATA6,PROX1,ONECUT1,MEIS2）和癌症发病机理相关的gene（YAP1,TEAD1,PROX1,IGF1）。KRAS的激活和TP53的失活，PDAC样本中的cfDNA羟甲基基因组差异化富集在了PDAC肿瘤中通常被失调的基因中。使用基因中5hmC密度构建的正则化回归模型的AUC分别为0.92(发现数据集，n=79)和0.92-0.94(两个独立的测试集，n=)。此外，组织来源的5hmC特征可用于对PDAC的cfDNA进行分类(AUC=0.88)。结论：这些发现表明，即使在疾病早期，5hmC的变化也可用于PDAC的分类。

中文题目：在循环细胞DNA中使用5-羟甲基胞嘧啶标记物检测早期胰腺癌

英文题目：Detectionofearlystagepancreaticcancerusing5-hydroxymethylcytosinesignaturesincirculatingcellfreeDNA

期刊：Nature

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